26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3401 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  677    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  74.75 
 
 		 339 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  73.86 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  54.79 
 
 		 310 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  48.92 
 
 		 333 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  48.34 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  41.29 
 
 		 303 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  43.89 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  42.54 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  37.23 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  37.88 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  36.09 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  30.03 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  29.65 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  25.46 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  31.14 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  23.16 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  24.91 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  24.91 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  22.48 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  21.38 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  22.52 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  21.45 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  21.71 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  21.71 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  21.71 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>