57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4046 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4046  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  706    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3664  hypothetical protein  82.63 
 
 		 354 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0982  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.15 
 
 		 326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0152771  normal  0.420288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  30.19 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  26.74 
 
 		 167 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  28.57 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  29.01 
 
 		 165 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  27.67 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  27.67 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  28.75 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  28.22 
 
 		 166 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  29.25 
 
 		 168 aa  57  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  25.5 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  28.82 
 
 		 165 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  27.98 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  28.93 
 
 		 165 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  29.27 
 
 		 164 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  28.29 
 
 		 166 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  27.98 
 
 		 184 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  29.01 
 
 		 164 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  27.63 
 
 		 166 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6824  hypothetical protein  26.39 
 
 		 180 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  24.04 
 
 		 182 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  27.17 
 
 		 163 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  29.09 
 
 		 164 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  26.67 
 
 		 182 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2050  hypothetical protein  31.4 
 
 		 169 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  26.25 
 
 		 169 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4719  hypothetical protein  28.45 
 
 		 163 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3205  hypothetical protein  31.4 
 
 		 169 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  26.88 
 
 		 166 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  30.51 
 
 		 1211 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  23.63 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2924  hypothetical protein  31.2 
 
 		 169 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345356  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  29.41 
 
 		 166 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  25.15 
 
 		 164 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  26.95 
 
 		 166 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2967  hypothetical protein  31.4 
 
 		 169 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  27.67 
 
 		 166 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  30.43 
 
 		 168 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  29.63 
 
 		 166 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  27.44 
 
 		 166 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3190  hypothetical protein  31.4 
 
 		 169 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  26.71 
 
 		 166 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3212  hypothetical protein  30.58 
 
 		 169 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.480302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  26.25 
 
 		 166 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3225  hypothetical protein  30.58 
 
 		 169 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  26.25 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  25.79 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  25.79 
 
 		 168 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  37.33 
 
 		 165 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  27.22 
 
 		 166 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  27.85 
 
 		 163 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2739  hypothetical protein  28.07 
 
 		 178 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2561  hypothetical protein  28.07 
 
 		 178 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328994 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  26.01 
 
 		 185 aa  43.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  25.79 
 
 		 166 aa  42.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>