35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3664 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3664  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  721    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4046  hypothetical protein  82.63 
 
 		 348 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0982  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.39 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0152771  normal  0.420288 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  25.14 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  27.5 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  27.5 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  24.7 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  25.79 
 
 		 170 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  27.39 
 
 		 168 aa  54.3  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  24.83 
 
 		 169 aa  52.8  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  30.59 
 
 		 166 aa  52.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  26.54 
 
 		 165 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4719  hypothetical protein  26.13 
 
 		 163 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  23.21 
 
 		 184 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  24.86 
 
 		 182 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  24.05 
 
 		 167 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  29.27 
 
 		 164 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  22.6 
 
 		 184 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  23.87 
 
 		 166 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  26.59 
 
 		 182 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  27.04 
 
 		 165 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  24.42 
 
 		 163 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  23.75 
 
 		 166 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  25 
 
 		 169 aa  47  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  28.85 
 
 		 168 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  26.42 
 
 		 165 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2924  hypothetical protein  27.12 
 
 		 169 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345356  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  27.88 
 
 		 164 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  26.88 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2050  hypothetical protein  29.17 
 
 		 169 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  27.67 
 
 		 165 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3205  hypothetical protein  27.12 
 
 		 169 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2967  hypothetical protein  29.17 
 
 		 169 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  26.11 
 
 		 168 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  26.54 
 
 		 164 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>