39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6824 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6824  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  373  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3837  hypothetical protein  54.86 
 
 
172 aa  197  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0455557  normal  0.186197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  51.46 
 
 
440 aa  184  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2341  hypothetical protein  49.71 
 
 
178 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2302  hypothetical protein  49.12 
 
 
178 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2349  hypothetical protein  49.12 
 
 
178 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.996131  normal  0.40591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1626  hypothetical protein  49.71 
 
 
172 aa  168  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.25806  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3588  hypothetical protein  48.84 
 
 
179 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1619  hypothetical protein  47.43 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0168  hypothetical protein  50.6 
 
 
186 aa  158  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0586014  hitchhiker  0.00159646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3140  hypothetical protein  44.38 
 
 
182 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3194  hypothetical protein  45.86 
 
 
175 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0249  hypothetical protein  39.05 
 
 
178 aa  135  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4121  hypothetical protein  30.63 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4719  hypothetical protein  31.85 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4718  hypothetical protein  30.08 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.841461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5817  hypothetical protein  35.33 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0739002 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2510  hypothetical protein  35.33 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2485  hypothetical protein  35.33 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247723  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1874  hypothetical protein  35.33 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0810  hypothetical protein  34 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2535  hypothetical protein  21.92 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2721  hypothetical protein  21.92 
 
 
181 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.931397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2739  hypothetical protein  23.66 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4046  hypothetical protein  26.39 
 
 
348 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2561  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2164  hypothetical protein  25.78 
 
 
167 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5150  hypothetical protein  28.95 
 
 
265 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953458  normal  0.848827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2459  hypothetical protein  21.92 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2495  hypothetical protein  21.23 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000659844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2783  hypothetical protein  21.23 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3981  hypothetical protein  27.27 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0463  hypothetical protein  28.21 
 
 
152 aa  45.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.940424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2766  hypothetical protein  22.03 
 
 
178 aa  44.3  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401115  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5113  hypothetical protein  27.93 
 
 
268 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3255  hypothetical protein  27.93 
 
 
268 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0053  hypothetical protein  29.25 
 
 
168 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3664  hypothetical protein  20.79 
 
 
354 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60307  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0525  hypothetical protein  26.13 
 
 
268 aa  40.8  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0129049  normal  0.663626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>