65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2936 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2936  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2937  hypothetical protein  92.95 
 
 		 242 aa  394  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1952  hypothetical protein  81.01 
 
 		 237 aa  377  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409436  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1953  hypothetical protein  83.26 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178671  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3435  hypothetical protein  61.47 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10107  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3734  protein of unknown function DUF820  60.75 
 
 		 223 aa  252  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0879  protein of unknown function DUF820  56.34 
 
 		 222 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222947  hitchhiker  0.0000240663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1997  hypothetical protein  55.76 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.611107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0960  protein of unknown function DUF820  48.4 
 
 		 226 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.457496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1713  hypothetical protein  56.02 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1895  protein of unknown function DUF820  48.43 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1869  protein of unknown function DUF820  48.43 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1679  hypothetical protein  59 
 
 		 113 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0131  hypothetical protein  47.87 
 
 		 94 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818485  decreased coverage  0.00619864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  33.51 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  32.11 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  32.11 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  27.27 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  29.19 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  43.27 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  29.5 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  29.5 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  25.42 
 
 		 193 aa  52.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 		 191 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  28.73 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  31.18 
 
 		 188 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  38.06 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  27.37 
 
 		 184 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  26.53 
 
 		 192 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  28.67 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  30.41 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  22.68 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  30.56 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  29.17 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  30.97 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  31.11 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  25.93 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  29.71 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  31.71 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  31.17 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  35.48 
 
 		 180 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  26.2 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  33.72 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  29.41 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  28.33 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  30.6 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  27.93 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  29.2 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  24.29 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  27.53 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  60.53 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  29.45 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  30.92 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  32.2 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  35.21 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  27.98 
 
 		 184 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  31.03 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5058  protein of unknown function DUF820  32.69 
 
 		 213 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  27.37 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  23.6 
 
 		 189 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  25.55 
 
 		 182 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  29.52 
 
 		 203 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  25.48 
 
 		 193 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>