35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1895 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1895  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
226 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0867357  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1869  protein of unknown function DUF820  99.56 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0960  protein of unknown function DUF820  81.82 
 
 
226 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.457496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0879  protein of unknown function DUF820  62.26 
 
 
222 aa  280  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222947  hitchhiker  0.0000240663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3734  protein of unknown function DUF820  58.56 
 
 
223 aa  272  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3435  hypothetical protein  52.8 
 
 
233 aa  241  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10107  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1997  hypothetical protein  53.18 
 
 
221 aa  241  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.611107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1713  hypothetical protein  52.27 
 
 
223 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2937  hypothetical protein  51.39 
 
 
242 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1952  hypothetical protein  50.47 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409436  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2936  hypothetical protein  48.43 
 
 
244 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1953  hypothetical protein  51.4 
 
 
241 aa  208  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178671  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1679  hypothetical protein  69.61 
 
 
113 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0131  hypothetical protein  54.84 
 
 
94 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818485  decreased coverage  0.00619864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 
184 aa  51.6  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  28.42 
 
 
187 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0954  protein of unknown function DUF820  28.39 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  25.54 
 
 
200 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  32.8 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  31.58 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5058  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  33.05 
 
 
191 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  26.63 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  26.63 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  28.35 
 
 
192 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  27.89 
 
 
197 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  26.6 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  43.33 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  27.89 
 
 
189 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  32.99 
 
 
252 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  32.99 
 
 
243 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  32.99 
 
 
243 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  32.99 
 
 
252 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>