36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1997 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1997  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.611107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1713  hypothetical protein  85.25 
 
 		 223 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0879  protein of unknown function DUF820  59.91 
 
 		 222 aa  255  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222947  hitchhiker  0.0000240663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0960  protein of unknown function DUF820  55.5 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.457496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3435  hypothetical protein  56.6 
 
 		 233 aa  238  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10107  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3734  protein of unknown function DUF820  56.74 
 
 		 223 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1895  protein of unknown function DUF820  53.18 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1952  hypothetical protein  56.62 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409436  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1869  protein of unknown function DUF820  53.18 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1953  hypothetical protein  56.88 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178671  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2937  hypothetical protein  56.88 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2936  hypothetical protein  55.76 
 
 		 244 aa  215  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1679  hypothetical protein  68.48 
 
 		 113 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0131  hypothetical protein  47.31 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818485  decreased coverage  0.00619864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  27.78 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  28.35 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  27.81 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  31.18 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  30.5 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  31.79 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  23.86 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  25.28 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5520  protein of unknown function DUF820  28.38 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  26.71 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  25.66 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5058  protein of unknown function DUF820  30.07 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  29.05 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  26.53 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  26.32 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  26.59 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  23.78 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  32.12 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1018  protein of unknown function DUF820  28.75 
 
 		 309 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.670173  normal  0.130086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  28.38 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>