42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0960 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0960  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
226 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.457496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1895  protein of unknown function DUF820  81.82 
 
 
226 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0867357  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1869  protein of unknown function DUF820  81.36 
 
 
226 aa  353  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0879  protein of unknown function DUF820  61.61 
 
 
222 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222947  hitchhiker  0.0000240663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3734  protein of unknown function DUF820  61.03 
 
 
223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1997  hypothetical protein  55.5 
 
 
221 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.611107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3435  hypothetical protein  52.63 
 
 
233 aa  237  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10107  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1713  hypothetical protein  53.21 
 
 
223 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1952  hypothetical protein  49.52 
 
 
237 aa  213  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409436  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2936  hypothetical protein  48.4 
 
 
244 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2937  hypothetical protein  50.48 
 
 
242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1953  hypothetical protein  51.43 
 
 
241 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178671  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1679  hypothetical protein  68.63 
 
 
113 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0131  hypothetical protein  54.84 
 
 
94 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818485  decreased coverage  0.00619864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  28.14 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  27.22 
 
 
184 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  27.62 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  33.04 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  25.7 
 
 
191 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  29.29 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  31.68 
 
 
227 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  27.91 
 
 
181 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
183 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  28.48 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  24.48 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1855  protein of unknown function DUF820  26.99 
 
 
182 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  34.44 
 
 
195 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1881  protein of unknown function DUF820  26.99 
 
 
182 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  26.74 
 
 
182 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5058  protein of unknown function DUF820  31.09 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0954  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  26.55 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  28.91 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  24.7 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  28.64 
 
 
191 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  39.71 
 
 
180 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  29.8 
 
 
193 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  27.41 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  25.28 
 
 
191 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  32.28 
 
 
188 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 
191 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>