69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3435 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3435  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10107  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3734  protein of unknown function DUF820  60.93 
 
 		 223 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1952  hypothetical protein  62.15 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409436  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0879  protein of unknown function DUF820  58.49 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222947  hitchhiker  0.0000240663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2937  hypothetical protein  63.08 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1953  hypothetical protein  60.79 
 
 		 241 aa  248  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178671  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2936  hypothetical protein  61.47 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1997  hypothetical protein  56.6 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.611107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0960  protein of unknown function DUF820  52.63 
 
 		 226 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.457496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1869  protein of unknown function DUF820  53.27 
 
 		 226 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1895  protein of unknown function DUF820  52.8 
 
 		 226 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1713  hypothetical protein  54.72 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1679  hypothetical protein  64.58 
 
 		 113 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0131  hypothetical protein  48.94 
 
 		 94 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818485  decreased coverage  0.00619864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  27.62 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  31.97 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  30.21 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  31.29 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  30.2 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  32.07 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  32.05 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  30.21 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  29.63 
 
 		 202 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  42.17 
 
 		 198 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  34.91 
 
 		 189 aa  52  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  29.8 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  28.69 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  29.59 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  27.71 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  29.7 
 
 		 182 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  28.05 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  26.78 
 
 		 200 aa  48.5  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  32.77 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  30.28 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  25.62 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  29.61 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  28.99 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  31.58 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  30.92 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  28.29 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  28.27 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  26.82 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  25.85 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  25.14 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  31.58 
 
 		 190 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5058  protein of unknown function DUF820  28.47 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  26.7 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5520  protein of unknown function DUF820  28 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387826 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  26.11 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  24.88 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  28.48 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  29.09 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  30.46 
 
 		 191 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0102  hypothetical protein  29.24 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  34.01 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0954  protein of unknown function DUF820  29.93 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  31.73 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  27.57 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  39.51 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  28.86 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2406  protein of unknown function DUF820  31.62 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2463  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  32.89 
 
 		 182 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  28.9 
 
 		 209 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  24.86 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  34.25 
 
 		 189 aa  42  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  30.53 
 
 		 200 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>