37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6077 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6077  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 267 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  49.81 
 
 		 270 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  47.15 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  46.77 
 
 		 270 aa  245  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  46.27 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  43.54 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  47.92 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4844  beta-lactamase-like protein  45.69 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  42.07 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3431  metallo-beta-lactamase family protein  41.7 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  42.44 
 
 		 276 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  42.07 
 
 		 274 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  42.07 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3428  hypothetical protein  42.44 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3417  metallo-beta-lactamase family protein  42.44 
 
 		 275 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5726  beta-lactamase-like protein  46.3 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  42.07 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1780  beta-lactamase-like protein  44.32 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3444  metallo-beta-lactamase family protein  42.07 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2296  hydrolase  41.33 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000420805  hitchhiker  9.85282e-22 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1316  hypothetical protein  45.26 
 
 		 235 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.851569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1367  hydrolase  39.41 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0592  beta-lactamase domain protein  39.62 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00970  conserved hypothetical protein  37.46 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00651288  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3295  beta-lactamase-like protein  38.27 
 
 		 279 aa  175  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.796583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1968  hydrolase  36.25 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01947  metallo-beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12770)  34.75 
 
 		 318 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.482558  normal  0.183653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4894  hypothetical protein  24.33 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3429  hypothetical protein  27.14 
 
 		 311 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0907  hypothetical protein  24.62 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4969  hypothetical protein  24.08 
 
 		 290 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4506  hypothetical protein  24.08 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.898887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1022  hypothetical protein  27.82 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5022  hypothetical protein  22.86 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.594748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2342  hypothetical protein  41.25 
 
 		 112 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.303536  normal  0.348773 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  27.67 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 204 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>