27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2342 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2342  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  215  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.303536  normal  0.348773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4844  beta-lactamase-like protein  69.88 
 
 
283 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00970  conserved hypothetical protein  50 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00651288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  51.32 
 
 
269 aa  73.6  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1367  hydrolase  44.3 
 
 
271 aa  70.1  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  40.7 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  43.21 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  43.04 
 
 
275 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  43.04 
 
 
274 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  43.04 
 
 
274 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  43.04 
 
 
275 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1968  hydrolase  43.9 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3444  metallo-beta-lactamase family protein  41.98 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3417  metallo-beta-lactamase family protein  41.98 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2296  hydrolase  42.53 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000420805  hitchhiker  9.85282e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3431  metallo-beta-lactamase family protein  40.74 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01947  metallo-beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12770)  45.78 
 
 
318 aa  64.3  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.482558  normal  0.183653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
270 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3428  hypothetical protein  41.98 
 
 
274 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  43.37 
 
 
270 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1780  beta-lactamase-like protein  39.47 
 
 
263 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  44.87 
 
 
270 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6077  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 
267 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5726  beta-lactamase-like protein  38.82 
 
 
270 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  45.57 
 
 
270 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3295  beta-lactamase-like protein  41.46 
 
 
279 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.796583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0592  beta-lactamase domain protein  36.71 
 
 
284 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>