38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0984 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  97.41 
 
 		 270 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  87.41 
 
 		 270 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  77.04 
 
 		 270 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1780  beta-lactamase-like protein  59.77 
 
 		 263 aa  316  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  56.11 
 
 		 269 aa  299  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5726  beta-lactamase-like protein  59.54 
 
 		 270 aa  295  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  49.43 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  49.05 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  49.05 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  49.05 
 
 		 274 aa  285  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  48.67 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2296  hydrolase  47.53 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000420805  hitchhiker  9.85282e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  48.67 
 
 		 276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3444  metallo-beta-lactamase family protein  49.05 
 
 		 275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3431  metallo-beta-lactamase family protein  47.91 
 
 		 275 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3417  metallo-beta-lactamase family protein  48.29 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3428  hypothetical protein  47.19 
 
 		 274 aa  275  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6077  beta-lactamase domain protein  46.77 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4844  beta-lactamase-like protein  45.96 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1367  hydrolase  46.01 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1968  hydrolase  44.02 
 
 		 270 aa  201  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3295  beta-lactamase-like protein  45.42 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.796583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1316  hypothetical protein  44.64 
 
 		 235 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.851569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0592  beta-lactamase domain protein  41.31 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01947  metallo-beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12770)  39.58 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.482558  normal  0.183653 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00970  conserved hypothetical protein  33.57 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00651288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3429  hypothetical protein  29.8 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0907  hypothetical protein  27.07 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1022  hypothetical protein  30.77 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4969  hypothetical protein  27.02 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4506  hypothetical protein  27.35 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.898887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5022  hypothetical protein  26.12 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.594748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2342  hypothetical protein  46.05 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.303536  normal  0.348773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  31.1 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0310  hypothetical protein  23.35 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00534395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0293  hypothetical protein  23.71 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>