42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3429 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3429  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  625  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1022  hypothetical protein  65.47 
 
 		 290 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4506  hypothetical protein  46.18 
 
 		 290 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.898887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4969  hypothetical protein  46.18 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0907  hypothetical protein  43.27 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5022  hypothetical protein  44.93 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.594748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4894  hypothetical protein  46.32 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  31.95 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  29.8 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6077  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 267 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1968  hydrolase  31.47 
 
 		 270 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  29.69 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 		 270 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1367  hydrolase  30.53 
 
 		 271 aa  89.7  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0592  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  27.68 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 		 275 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  24.1 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1316  hypothetical protein  29.19 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.851569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4844  beta-lactamase-like protein  27.53 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3444  metallo-beta-lactamase family protein  24.1 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3431  metallo-beta-lactamase family protein  24.21 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  24.3 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  23.48 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3417  metallo-beta-lactamase family protein  23.29 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3428  hypothetical protein  23.69 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3295  beta-lactamase-like protein  29.03 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.796583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1780  beta-lactamase-like protein  25.33 
 
 		 263 aa  67  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349631 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2296  hydrolase  20.24 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000420805  hitchhiker  9.85282e-22 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00970  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00651288  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5726  beta-lactamase-like protein  24.56 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  58.54 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  56.1 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  52.5 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  48.78 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  56.41 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  56.41 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  48.84 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  56.41 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  48.78 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>