35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1367 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1367  hydrolase  100 
 
 
271 aa  547  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3295  beta-lactamase-like protein  69.29 
 
 
279 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.796583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1968  hydrolase  60.37 
 
 
270 aa  338  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0592  beta-lactamase domain protein  48.66 
 
 
284 aa  227  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  43.43 
 
 
276 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  43.38 
 
 
275 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  43.38 
 
 
274 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  43.38 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  42.7 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  41.97 
 
 
274 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  46.24 
 
 
269 aa  218  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3431  metallo-beta-lactamase family protein  42.65 
 
 
275 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3444  metallo-beta-lactamase family protein  42.7 
 
 
275 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3417  metallo-beta-lactamase family protein  41.97 
 
 
275 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  45.56 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3428  hypothetical protein  41.97 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2296  hydrolase  40.51 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000420805  hitchhiker  9.85282e-22 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  46.01 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  44.49 
 
 
270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4844  beta-lactamase-like protein  43.68 
 
 
283 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  44.49 
 
 
270 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1780  beta-lactamase-like protein  39.33 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349631 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6077  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 
267 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5726  beta-lactamase-like protein  40.44 
 
 
270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1316  hypothetical protein  39.32 
 
 
235 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.851569 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00970  conserved hypothetical protein  32.13 
 
 
321 aa  152  7e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00651288  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01947  metallo-beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12770)  32.26 
 
 
318 aa  123  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.482558  normal  0.183653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4894  hypothetical protein  30.89 
 
 
287 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3429  hypothetical protein  30.53 
 
 
311 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0907  hypothetical protein  26.83 
 
 
291 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4969  hypothetical protein  28.28 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4506  hypothetical protein  27.87 
 
 
290 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.898887  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5022  hypothetical protein  27.46 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.594748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1022  hypothetical protein  27.47 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2342  hypothetical protein  46.58 
 
 
112 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.303536  normal  0.348773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>