34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4894 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4894  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  577  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0907  hypothetical protein  79.02 
 
 		 291 aa  474  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4506  hypothetical protein  80.07 
 
 		 290 aa  474  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.898887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4969  hypothetical protein  79.72 
 
 		 290 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5022  hypothetical protein  79.37 
 
 		 290 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.594748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3429  hypothetical protein  46.32 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1022  hypothetical protein  42.07 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  33.74 
 
 		 269 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  33.2 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  27.8 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1367  hydrolase  30.89 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6077  beta-lactamase domain protein  24.33 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4844  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1968  hydrolase  30.35 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  27.45 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  26.47 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  26.47 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3444  metallo-beta-lactamase family protein  28.02 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  26.47 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  31.82 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3431  metallo-beta-lactamase family protein  25.98 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3417  metallo-beta-lactamase family protein  26.47 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1780  beta-lactamase-like protein  30.93 
 
 		 263 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349631 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3428  hypothetical protein  26.47 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2296  hydrolase  23.79 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000420805  hitchhiker  9.85282e-22 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0592  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3295  beta-lactamase-like protein  29.69 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.796583  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5726  beta-lactamase-like protein  30.28 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00970  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00651288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1316  hypothetical protein  28.11 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.851569 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01947  metallo-beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12770)  23.25 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.482558  normal  0.183653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>