36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4969 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4969  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  597  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4506  hypothetical protein  98.62 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.898887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5022  hypothetical protein  94.48 
 
 		 290 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.594748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0907  hypothetical protein  87.59 
 
 		 291 aa  531  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4894  hypothetical protein  79.72 
 
 		 287 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3429  hypothetical protein  46.18 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1022  hypothetical protein  41.72 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  31.54 
 
 		 269 aa  109  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  29.26 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  23.66 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4844  beta-lactamase-like protein  30.83 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1367  hydrolase  28.28 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2296  hydrolase  23.6 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000420805  hitchhiker  9.85282e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3431  metallo-beta-lactamase family protein  23.51 
 
 		 275 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  27.02 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3444  metallo-beta-lactamase family protein  22.9 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  22.14 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  21.76 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  21.59 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  22.14 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  21.76 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3428  hypothetical protein  23.28 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3417  metallo-beta-lactamase family protein  22.52 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1968  hydrolase  28.28 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1780  beta-lactamase-like protein  29.69 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349631 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6077  beta-lactamase domain protein  24.08 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  29.61 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3295  beta-lactamase-like protein  27.06 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.796583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0592  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5726  beta-lactamase-like protein  29.58 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1316  hypothetical protein  25.24 
 
 		 235 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.851569 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00970  conserved hypothetical protein  22.01 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00651288  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01947  metallo-beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12770)  23.68 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.482558  normal  0.183653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5132  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  24.07 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>