38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0907 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0907  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4969  hypothetical protein  87.59 
 
 
290 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5022  hypothetical protein  89.16 
 
 
290 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.594748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4506  hypothetical protein  88.5 
 
 
290 aa  532  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.898887  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4894  hypothetical protein  79.02 
 
 
287 aa  474  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3429  hypothetical protein  43.27 
 
 
311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1022  hypothetical protein  40.89 
 
 
290 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  30.45 
 
 
269 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  29.26 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4844  beta-lactamase-like protein  30.83 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  25.49 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  27.07 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1367  hydrolase  26.83 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3431  metallo-beta-lactamase family protein  24.88 
 
 
275 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2296  hydrolase  22.8 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000420805  hitchhiker  9.85282e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3444  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6077  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  22.82 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1968  hydrolase  27.84 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  26.64 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1780  beta-lactamase-like protein  29.53 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349631 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3428  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3417  metallo-beta-lactamase family protein  24.02 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3295  beta-lactamase-like protein  27.06 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.796583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0592  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5726  beta-lactamase-like protein  29.58 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1316  hypothetical protein  26.54 
 
 
235 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.851569 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00970  conserved hypothetical protein  22.01 
 
 
321 aa  52.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00651288  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01947  metallo-beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12770)  23.25 
 
 
318 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.482558  normal  0.183653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5132  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
227 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  22.58 
 
 
299 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0310  hypothetical protein  26.09 
 
 
238 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00534395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  24.16 
 
 
290 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>