35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1022 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1022  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  590  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3429  hypothetical protein  65.47 
 
 		 311 aa  350  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4969  hypothetical protein  41.72 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0907  hypothetical protein  40.89 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4506  hypothetical protein  41.03 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.898887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5022  hypothetical protein  40.69 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.594748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4894  hypothetical protein  42.07 
 
 		 287 aa  195  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  31.6 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  29.96 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4844  beta-lactamase-like protein  28.02 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  24.12 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  32.2 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  23.64 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3444  metallo-beta-lactamase family protein  23.74 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  23.17 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3428  hypothetical protein  23.05 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6077  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1367  hydrolase  27.47 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3431  metallo-beta-lactamase family protein  23.74 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3417  metallo-beta-lactamase family protein  23.17 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1316  hypothetical protein  31.61 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.851569 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  22.96 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2296  hydrolase  24.24 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000420805  hitchhiker  9.85282e-22 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0592  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1968  hydrolase  26.97 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3295  beta-lactamase-like protein  26.69 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.796583  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00970  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00651288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1780  beta-lactamase-like protein  26.4 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349631 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01947  metallo-beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12770)  21.45 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.482558  normal  0.183653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  51.22 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  48.78 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>