35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1316 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1316  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.851569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4844  beta-lactamase-like protein  46.41 
 
 		 283 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3444  metallo-beta-lactamase family protein  42.19 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  42.62 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  41.77 
 
 		 274 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  41.77 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  41.77 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  41.77 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  41.77 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6077  beta-lactamase domain protein  45.26 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3431  metallo-beta-lactamase family protein  40.51 
 
 		 275 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3417  metallo-beta-lactamase family protein  42.4 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3428  hypothetical protein  45.5 
 
 		 274 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2296  hydrolase  41.94 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000420805  hitchhiker  9.85282e-22 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  46.55 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  44.64 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  44.3 
 
 		 270 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  42.67 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  42.49 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1780  beta-lactamase-like protein  41.81 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1968  hydrolase  41.99 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5726  beta-lactamase-like protein  43.1 
 
 		 270 aa  171  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1367  hydrolase  39.32 
 
 		 271 aa  161  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0592  beta-lactamase domain protein  39.81 
 
 		 284 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3295  beta-lactamase-like protein  38.61 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.796583  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00970  conserved hypothetical protein  31.8 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00651288  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01947  metallo-beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12770)  29.81 
 
 		 318 aa  95.1  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.482558  normal  0.183653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3429  hypothetical protein  29.19 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1022  hypothetical protein  31.61 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4894  hypothetical protein  28.11 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0907  hypothetical protein  26.54 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4969  hypothetical protein  25.24 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4506  hypothetical protein  25.73 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.898887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5022  hypothetical protein  25.59 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.594748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>