25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5622 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5622  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7221  Flp pilus assembly protein CpaB  94.65 
 
 		 318 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283104  normal  0.15855 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  28.27 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  43.06 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  50 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  26.09 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  42.55 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  48.48 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  44.3 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  40.3 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  39.13 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  40 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  43.75 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  39.68 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  34.88 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  32.63 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  42.47 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  38.1 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  38.1 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  38.1 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  22.98 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  44.44 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  32.73 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  46.88 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  40.35 
 
 		 233 aa  42.4  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>