60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1928 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  100 
 
 
184 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  89.62 
 
 
184 aa  344  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  52.07 
 
 
174 aa  168  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  51.46 
 
 
184 aa  168  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  50 
 
 
180 aa  167  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  50.27 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  49.13 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.54 
 
 
180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  47.13 
 
 
181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4639  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  49.44 
 
 
182 aa  157  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000460049  normal  0.20738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  46.78 
 
 
180 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  44.25 
 
 
186 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  47.13 
 
 
194 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  46.78 
 
 
182 aa  153  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.26 
 
 
182 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  47.95 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  47.16 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  49.12 
 
 
180 aa  151  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  43.93 
 
 
180 aa  149  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  42.53 
 
 
186 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  44.63 
 
 
192 aa  148  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  43.65 
 
 
211 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  47.95 
 
 
182 aa  147  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.26 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  44.38 
 
 
180 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  40.88 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5760  phosphate acetyltransferase  46.58 
 
 
394 aa  137  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0192173  hitchhiker  0.0000000000000462587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.24 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  43.35 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.55 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  41.04 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  45.95 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  38.12 
 
 
185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000161899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  46.24 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  42.77 
 
 
184 aa  124  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  42.77 
 
 
184 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  42.77 
 
 
184 aa  124  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  42.77 
 
 
184 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  42.2 
 
 
194 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  42.2 
 
 
184 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  42.2 
 
 
184 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0527  phosphotransferase KptA/Tpt1  35.75 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1047  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  36.36 
 
 
211 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376567  normal  0.793229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0962  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  33.14 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56016  predicted protein  34.25 
 
 
209 aa  96.3  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.047688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1765  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  32.37 
 
 
216 aa  95.5  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0018  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  33.13 
 
 
209 aa  91.3  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.840157  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  31.93 
 
 
209 aa  88.2  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0908  phosphotransferase KptA/Tpt1  30.34 
 
 
253 aa  88.2  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1409  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  32.16 
 
 
215 aa  87.8  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2307  phosphotransferase KptA/Tpt1  31.84 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.545628  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1549  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  31.58 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21228  predicted protein  28.5 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4144  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like  49.15 
 
 
106 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00880983  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4222  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  49.15 
 
 
83 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1544  phosphotransferase KptA/Tpt1  25.53 
 
 
253 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00427558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0839  phosphotransferase KptA/Tpt1  25 
 
 
247 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0385  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  65.62 
 
 
46 aa  51.2  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10567  tRNA splicing 2' phosphotransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_2G02890)  24.32 
 
 
350 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0307088 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00310  tRNA 2'-phosphotransferase, putative  29.91 
 
 
352 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0508161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>