60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5760 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5760  phosphate acetyltransferase  100 
 
 
394 aa  808    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0192173  hitchhiker  0.0000000000000462587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0349  phosphate acetyltransferase  61.69 
 
 
208 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0111439  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1178  hypothetical protein  58.79 
 
 
199 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4328  hypothetical protein  59.39 
 
 
201 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.362343  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4428  hypothetical protein  65.87 
 
 
179 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0947  phosphate acetyltransferase  54.17 
 
 
230 aa  219  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  54.67 
 
 
179 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  56.49 
 
 
182 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.8 
 
 
182 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  49.37 
 
 
180 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  55.84 
 
 
182 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4200  hypothetical protein  51.8 
 
 
164 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191721  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  49.67 
 
 
184 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  49.67 
 
 
184 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  49.67 
 
 
184 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  49.67 
 
 
194 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  49.35 
 
 
184 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  49.67 
 
 
184 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  51.25 
 
 
184 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  49.02 
 
 
184 aa  146  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  48 
 
 
195 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  37.57 
 
 
186 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  49.36 
 
 
211 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.98 
 
 
186 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  37.02 
 
 
186 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  48.72 
 
 
181 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  50 
 
 
194 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  46.15 
 
 
180 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  49.02 
 
 
187 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  46.58 
 
 
184 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  41.67 
 
 
182 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  46.1 
 
 
184 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  49.03 
 
 
174 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  42.86 
 
 
182 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.19 
 
 
180 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1384  hypothetical protein  59.82 
 
 
118 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  50 
 
 
176 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  41.06 
 
 
180 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  37.95 
 
 
192 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  47.37 
 
 
182 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  47.53 
 
 
187 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  50.71 
 
 
177 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4639  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  45.95 
 
 
182 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000460049  normal  0.20738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  45.33 
 
 
180 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  42 
 
 
180 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  40.94 
 
 
215 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  33.13 
 
 
185 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000161899  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0527  phosphotransferase KptA/Tpt1  39.89 
 
 
225 aa  96.3  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0018  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.48 
 
 
209 aa  93.6  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.840157  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  35.5 
 
 
182 aa  92.8  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1549  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  38.1 
 
 
216 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  37.67 
 
 
209 aa  89.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1047  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  36.73 
 
 
211 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376567  normal  0.793229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2307  phosphotransferase KptA/Tpt1  42.86 
 
 
201 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.545628  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56016  predicted protein  37.33 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.047688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0962  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  31.71 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0908  phosphotransferase KptA/Tpt1  30.13 
 
 
253 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1409  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  33.76 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1765  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  33.1 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0280  hypothetical protein  30.87 
 
 
197 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>