29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0839 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0839  phosphotransferase KptA/Tpt1  100 
 
 
247 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1544  phosphotransferase KptA/Tpt1  31.71 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00427558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  25.43 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  26.86 
 
 
180 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  25.58 
 
 
184 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  28.9 
 
 
187 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  28.8 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  25.71 
 
 
194 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  28.65 
 
 
174 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  25 
 
 
184 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  24.32 
 
 
180 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0908  phosphotransferase KptA/Tpt1  26.16 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  23.26 
 
 
185 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000161899  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0527  phosphotransferase KptA/Tpt1  29.9 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  24.86 
 
 
187 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  23.86 
 
 
186 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27.32 
 
 
182 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  27.84 
 
 
181 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  27.12 
 
 
180 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  26.15 
 
 
179 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  22.47 
 
 
182 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  24.86 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  24.02 
 
 
184 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  22.95 
 
 
194 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1047  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27.88 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376567  normal  0.793229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1549  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27.5 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  23.3 
 
 
184 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  26.32 
 
 
176 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  22.73 
 
 
184 aa  42  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>