43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1544 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1544  phosphotransferase KptA/Tpt1  100 
 
 		 253 aa  516  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00427558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  35.12 
 
 		 182 aa  98.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0839  phosphotransferase KptA/Tpt1  31.71 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  30.11 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000161899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  26.14 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  24.58 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  25 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  26.23 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  29.24 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  25.14 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  25.7 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.33 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  31.43 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  26.11 
 
 		 184 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27.42 
 
 		 194 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27.78 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27.78 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  27.78 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  27.78 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0908  phosphotransferase KptA/Tpt1  24.31 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  25 
 
 		 182 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  28.19 
 
 		 187 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  29.38 
 
 		 182 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  25.53 
 
 		 184 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  28.82 
 
 		 177 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  24.44 
 
 		 186 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  29.94 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0962  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  22.86 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  28.81 
 
 		 176 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  26.32 
 
 		 181 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  25.56 
 
 		 184 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  26.52 
 
 		 179 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1765  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  24.86 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0527  phosphotransferase KptA/Tpt1  26.04 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  27.17 
 
 		 180 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  25.56 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1409  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  25.29 
 
 		 215 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  25.28 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  24.26 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  22.99 
 
 		 184 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  32.94 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  24.72 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  20.65 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>