59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4788 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  51.96 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  56.42 
 
 		 182 aa  208  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  51.96 
 
 		 211 aa  204  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  54.86 
 
 		 194 aa  204  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  53.37 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  52.81 
 
 		 184 aa  201  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  52.81 
 
 		 184 aa  201  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  52.81 
 
 		 184 aa  200  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  52.81 
 
 		 184 aa  200  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  52.81 
 
 		 184 aa  200  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  52.81 
 
 		 184 aa  200  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  53.07 
 
 		 182 aa  197  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.04 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  54.12 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  51.65 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.04 
 
 		 180 aa  180  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  46.93 
 
 		 182 aa  178  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  49.44 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  46.11 
 
 		 195 aa  174  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  47.95 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  49.2 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  50.27 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  49.16 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  49.43 
 
 		 180 aa  160  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4639  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  46.37 
 
 		 182 aa  158  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000460049  normal  0.20738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  50 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  42.05 
 
 		 192 aa  156  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  46.37 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  41.62 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  45.56 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  40.56 
 
 		 186 aa  150  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  44.77 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  46.11 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  40.56 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.57 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  49.01 
 
 		 215 aa  143  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5760  phosphate acetyltransferase  49.02 
 
 		 394 aa  138  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0192173  hitchhiker  0.0000000000000462587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  43.02 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  39.43 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  40.44 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000161899  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1047  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.62 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376567  normal  0.793229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2307  phosphotransferase KptA/Tpt1  37.36 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.545628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0018  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  35.36 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.840157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.66 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1549  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  36.26 
 
 		 216 aa  97.4  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56016  predicted protein  32.42 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.047688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0527  phosphotransferase KptA/Tpt1  33.51 
 
 		 225 aa  92.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0962  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.42 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1409  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  29.71 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0908  phosphotransferase KptA/Tpt1  29.94 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1765  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27.87 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21228  predicted protein  29.61 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4144  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like  50.77 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00880983  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4222  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  50.77 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1544  phosphotransferase KptA/Tpt1  26.23 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00427558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0385  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  47.83 
 
 		 46 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0839  phosphotransferase KptA/Tpt1  24.86 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00310  tRNA 2'-phosphotransferase, putative  36.67 
 
 		 352 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0508161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>