60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0075 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  100 
 
 
180 aa  374  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  66.11 
 
 
182 aa  257  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  54.71 
 
 
180 aa  208  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  52.27 
 
 
182 aa  207  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  53.37 
 
 
182 aa  201  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  54.97 
 
 
179 aa  201  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  53.33 
 
 
195 aa  201  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  51.69 
 
 
180 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  52.25 
 
 
187 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.89 
 
 
186 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.59 
 
 
180 aa  184  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.89 
 
 
182 aa  183  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.6 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  48.6 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  48.6 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.6 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.6 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4639  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  52.22 
 
 
182 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000460049  normal  0.20738 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.04 
 
 
184 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  50 
 
 
192 aa  181  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  48.04 
 
 
187 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.04 
 
 
184 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  47.78 
 
 
181 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.54 
 
 
186 aa  176  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.84 
 
 
194 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  49.72 
 
 
211 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  47.95 
 
 
186 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.31 
 
 
184 aa  174  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  49.41 
 
 
180 aa  174  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  50.28 
 
 
182 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  47.78 
 
 
182 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  52.98 
 
 
215 aa  167  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  50.29 
 
 
176 aa  167  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  44.38 
 
 
180 aa  164  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.54 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  46.37 
 
 
184 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  46.11 
 
 
177 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  44.38 
 
 
174 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5760  phosphate acetyltransferase  49.37 
 
 
394 aa  151  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0192173  hitchhiker  0.0000000000000462587 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  42.05 
 
 
185 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000161899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  40.46 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0527  phosphotransferase KptA/Tpt1  37.04 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1047  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.5 
 
 
211 aa  107  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376567  normal  0.793229 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.5 
 
 
209 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0018  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  33.92 
 
 
209 aa  105  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.840157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2307  phosphotransferase KptA/Tpt1  33.68 
 
 
201 aa  101  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.545628  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1549  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  32.58 
 
 
216 aa  101  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1765  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  30.39 
 
 
216 aa  98.6  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0908  phosphotransferase KptA/Tpt1  31.72 
 
 
253 aa  94  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0962  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.49 
 
 
207 aa  91.3  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56016  predicted protein  31.75 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.047688 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1409  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  24.86 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21228  predicted protein  30.27 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1544  phosphotransferase KptA/Tpt1  25 
 
 
253 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00427558  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4144  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like  48.08 
 
 
106 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00880983  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4222  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  47.17 
 
 
83 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0839  phosphotransferase KptA/Tpt1  24.06 
 
 
247 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0385  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  48.78 
 
 
46 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10567  tRNA splicing 2' phosphotransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_2G02890)  37.1 
 
 
350 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0307088 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00310  tRNA 2'-phosphotransferase, putative  32.69 
 
 
352 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0508161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>