53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1409 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1409  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  100 
 
 
215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1765  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  50 
 
 
216 aa  231  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0962  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  48.04 
 
 
207 aa  207  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0908  phosphotransferase KptA/Tpt1  38.57 
 
 
253 aa  147  9e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0527  phosphotransferase KptA/Tpt1  34.86 
 
 
225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.34 
 
 
209 aa  118  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0018  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.67 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.840157  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  33.53 
 
 
182 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1047  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.07 
 
 
211 aa  102  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376567  normal  0.793229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1549  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.16 
 
 
216 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  35.2 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  29.48 
 
 
182 aa  95.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  30.81 
 
 
184 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  34.83 
 
 
180 aa  94  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  29.07 
 
 
192 aa  92.4  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  29.8 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  30.99 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4639  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  32.42 
 
 
182 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000460049  normal  0.20738 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  31.98 
 
 
180 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  32.16 
 
 
184 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  29.83 
 
 
182 aa  88.6  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  29.14 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  33.15 
 
 
180 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  30.68 
 
 
180 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  33.53 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  36.26 
 
 
174 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  28.95 
 
 
195 aa  85.5  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  35.29 
 
 
176 aa  84.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  29.71 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  31.07 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.57 
 
 
186 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  31.03 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000161899  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  32.39 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  34.71 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  31.18 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5760  phosphate acetyltransferase  33.76 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0192173  hitchhiker  0.0000000000000462587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  29.83 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  31.55 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  29.41 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  24.86 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  26.49 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  30.26 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.73 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.24 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  28.24 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2307  phosphotransferase KptA/Tpt1  28.49 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.545628  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  28.24 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27.65 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.24 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.24 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  28.99 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1544  phosphotransferase KptA/Tpt1  25.88 
 
 
253 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00427558  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56016  predicted protein  23.63 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.047688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>