60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0774 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  202  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  64.89 
 
 
94 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  47.87 
 
 
95 aa  103  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2592  hypothetical protein  37.89 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  37.78 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  36.67 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0618  conserved hypothetical protein  35.87 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02902  hypothetical protein  35.87 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.895884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4397  hypothetical protein  35.87 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02952  hypothetical protein  35.87 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3265  hypothetical protein  35.87 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1265  Sea40  34.41 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5397  hypothetical protein  41.89 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.418095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  31.58 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0617  hypothetical protein  34.78 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.950813  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0072  hypothetical protein  31.18 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0995766  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2945  hypothetical protein  30.11 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4355  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4264  Sea40  33.33 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4309  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0654025  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4242  Sea40  33.33 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66115  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0214  hypothetical protein  28.42 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0211  hypothetical protein  28.42 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106447  decreased coverage  0.000473791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4420  hypothetical protein  32.26 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0264  hypothetical protein  38.04 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0544079  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3483  hypothetical protein  36.96 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125562  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0735  hypothetical protein  38.46 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3977  hypothetical protein  36.26 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115023  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1596  hypothetical protein  32.22 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1700  hypothetical protein  32.22 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000135659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2131  hypothetical protein  40.54 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160329  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0727  hypothetical protein  28.89 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0295  putative cytoplasmic protein  32.26 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0816  hypothetical protein  36.26 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0252247  hitchhiker  0.00192585 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0756  hypothetical protein  28.89 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00817316  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4296  hypothetical protein  30.77 
 
 
100 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652995  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4863  hypothetical protein  34.07 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2813  hypothetical protein  28.89 
 
 
90 aa  52.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0560809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1390  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141608  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5738  hypothetical protein  33.7 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2786  hypothetical protein  34.48 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04054  hypothetical protein  36.78 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2130  hypothetical protein  35.11 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1147  hypothetical protein  32.61 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4802  hypothetical protein  35.11 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.926039  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31910  hypothetical protein  44 
 
 
60 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7325  hypothetical protein  31.11 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2481  hypothetical protein  32.97 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.751364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0407  Protein of unknown function DUF2136  35.06 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1614  hypothetical protein  32.99 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4241  hypothetical protein  30.67 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0395236  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2390  hypothetical protein  36.23 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4426  hypothetical protein  31.87 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5486  hypothetical protein  28.89 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1283  hypothetical protein  29.35 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0732526  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0290  hypothetical protein  52.78 
 
 
158 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0015092  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6761  Protein of unknown function DUF2136  29.9 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0776  Protein of unknown function DUF2136  26.09 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>