54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04054 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04054  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  206  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2786  hypothetical protein  82.11 
 
 		 101 aa  168  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2481  hypothetical protein  55 
 
 		 97 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.751364  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0776  Protein of unknown function DUF2136  54 
 
 		 99 aa  117  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4950  hypothetical protein  48 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2130  hypothetical protein  49 
 
 		 97 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1534  hypothetical protein  47 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2390  hypothetical protein  51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4863  hypothetical protein  45 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4802  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.926039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1283  hypothetical protein  45 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0732526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2088  hypothetical protein  45.92 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1147  hypothetical protein  42.57 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0266  hypothetical protein  53.01 
 
 		 91 aa  94  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1390  hypothetical protein  42 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141608  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0264  hypothetical protein  43.56 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0544079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0735  hypothetical protein  45.83 
 
 		 98 aa  87.4  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5486  hypothetical protein  42 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5529  hypothetical protein  44 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000518348  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5738  hypothetical protein  40.82 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4296  hypothetical protein  43 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0816  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0252247  hitchhiker  0.00192585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3483  hypothetical protein  36.63 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125562  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4241  hypothetical protein  41 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0395236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4426  hypothetical protein  40.2 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1614  hypothetical protein  40.95 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3110  hypothetical protein  50.68 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0232  hypothetical protein  39.81 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0163906 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0536  hypothetical protein  42.42 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0426698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4194  hypothetical protein  38.54 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1700  hypothetical protein  42.57 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000135659  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1596  hypothetical protein  42.57 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2131  hypothetical protein  37.08 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3977  hypothetical protein  35.64 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115023  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7325  hypothetical protein  32 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  36.84 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2592  hypothetical protein  34.04 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0727  hypothetical protein  36.17 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0756  hypothetical protein  36.17 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00817316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04071  hypothetical protein  80 
 
 		 38 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2140  hypothetical protein  59.52 
 
 		 48 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00438563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  37.23 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  37.23 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2813  hypothetical protein  34.04 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0560809  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6761  Protein of unknown function DUF2136  40.62 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0214  hypothetical protein  30.85 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0211  hypothetical protein  30.85 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106447  decreased coverage  0.000473791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  36.78 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  33.68 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  29.03 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  29.03 
 
 		 99 aa  48.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4145  hypothetical protein  30.3 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.410477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1265  Sea40  27.27 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>