51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5529 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5529  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000518348  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0816  hypothetical protein  42.27 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0252247  hitchhiker  0.00192585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04054  hypothetical protein  44 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5486  hypothetical protein  41.24 
 
 		 100 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1283  hypothetical protein  41.41 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0732526  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4950  hypothetical protein  41.24 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0776  Protein of unknown function DUF2136  39.39 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2130  hypothetical protein  40.21 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2786  hypothetical protein  43.01 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7325  hypothetical protein  40.21 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2481  hypothetical protein  39.18 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.751364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4241  hypothetical protein  36.08 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0395236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1700  hypothetical protein  37.11 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000135659  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1596  hypothetical protein  37.11 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2390  hypothetical protein  41.41 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0266  hypothetical protein  39.76 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4863  hypothetical protein  38.14 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4802  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.926039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1390  hypothetical protein  34.02 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141608  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4194  hypothetical protein  36.56 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1534  hypothetical protein  40.4 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1147  hypothetical protein  35.71 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0735  hypothetical protein  36.56 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2088  hypothetical protein  37.89 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336628  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5738  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4426  hypothetical protein  38.04 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1614  hypothetical protein  36.89 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3110  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0232  hypothetical protein  33.98 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0163906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0214  hypothetical protein  35.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0211  hypothetical protein  35.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106447  decreased coverage  0.000473791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3483  hypothetical protein  34.69 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125562  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4296  hypothetical protein  34.02 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2592  hypothetical protein  32.22 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0536  hypothetical protein  34.52 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0426698  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2813  hypothetical protein  36.67 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0560809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  35.56 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3977  hypothetical protein  32.61 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115023  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0727  hypothetical protein  36.67 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0756  hypothetical protein  36.67 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00817316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0264  hypothetical protein  33.67 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0544079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5397  hypothetical protein  40.85 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.418095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2131  hypothetical protein  27.91 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  34.44 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  34.44 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  28.89 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  28.89 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2140  hypothetical protein  52.5 
 
 		 48 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00438563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  32.22 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4145  hypothetical protein  24.73 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.410477 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6761  Protein of unknown function DUF2136  26.04 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>