60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0776 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0776  Protein of unknown function DUF2136  100 
 
 
99 aa  203  8e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1283  hypothetical protein  55.56 
 
 
103 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0732526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2088  hypothetical protein  52.58 
 
 
97 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04054  hypothetical protein  54 
 
 
100 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2481  hypothetical protein  51.52 
 
 
97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.751364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1534  hypothetical protein  50.51 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4950  hypothetical protein  51.52 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561609  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2390  hypothetical protein  47.47 
 
 
103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2786  hypothetical protein  52.69 
 
 
101 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2130  hypothetical protein  45.45 
 
 
97 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4802  hypothetical protein  41.41 
 
 
104 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.926039  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0266  hypothetical protein  56.1 
 
 
91 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1390  hypothetical protein  47.47 
 
 
101 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141608  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0735  hypothetical protein  51.06 
 
 
98 aa  99.8  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0232  hypothetical protein  40.78 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0163906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1614  hypothetical protein  38.83 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4863  hypothetical protein  41.41 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4194  hypothetical protein  46.74 
 
 
94 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4296  hypothetical protein  43.43 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652995  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5486  hypothetical protein  41.41 
 
 
100 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189527 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5738  hypothetical protein  39.36 
 
 
114 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5529  hypothetical protein  39.39 
 
 
97 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000518348  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0264  hypothetical protein  39 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0544079  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0816  hypothetical protein  35.42 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0252247  hitchhiker  0.00192585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1147  hypothetical protein  38 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1596  hypothetical protein  37.37 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1700  hypothetical protein  37.37 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000135659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4426  hypothetical protein  34.04 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3110  hypothetical protein  41.77 
 
 
103 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3977  hypothetical protein  37.23 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115023  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2131  hypothetical protein  41.33 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160329  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3483  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125562  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0536  hypothetical protein  39.39 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0426698  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2592  hypothetical protein  38.04 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6761  Protein of unknown function DUF2136  38.78 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  38.04 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7325  hypothetical protein  28.28 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  38.04 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  37.89 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4241  hypothetical protein  30.53 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0395236  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4145  hypothetical protein  41.33 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.410477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  31.52 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2140  hypothetical protein  56.82 
 
 
48 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00438563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  31.52 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  31.52 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2813  hypothetical protein  33.7 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0560809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0727  hypothetical protein  32.61 
 
 
93 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0214  hypothetical protein  30.43 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0211  hypothetical protein  30.43 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106447  decreased coverage  0.000473791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0756  hypothetical protein  31.52 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00817316  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  30.43 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0618  conserved hypothetical protein  30.85 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02902  hypothetical protein  30.85 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.895884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4397  hypothetical protein  30.85 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3265  hypothetical protein  30.85 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02952  hypothetical protein  30.85 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04071  hypothetical protein  66.67 
 
 
38 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0617  hypothetical protein  29.79 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.950813  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2945  hypothetical protein  25.77 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  26.09 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>