48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0617 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0617  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.950813  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0618  conserved hypothetical protein  99.04 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02902  hypothetical protein  99.04 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.895884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4397  hypothetical protein  99.04 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02952  hypothetical protein  99.04 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3265  hypothetical protein  99.04 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0072  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0995766  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4264  Sea40  40.4 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4242  Sea40  40.4 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4309  hypothetical protein  40.4 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0654025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4420  hypothetical protein  39.39 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4355  hypothetical protein  39.39 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1265  Sea40  39.39 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2945  hypothetical protein  36.96 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  41.94 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  41.94 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0295  putative cytoplasmic protein  37.37 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  43.48 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  38.04 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  34.78 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31910  hypothetical protein  48.98 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0407  Protein of unknown function DUF2136  30.93 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267838  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  35 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  32.61 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  34 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5738  hypothetical protein  36.46 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3550  hypothetical protein  96 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4296  hypothetical protein  30.43 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5486  hypothetical protein  28.12 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189527 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0264  hypothetical protein  29.35 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0544079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2592  hypothetical protein  31.63 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3977  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115023  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1596  hypothetical protein  31.52 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1700  hypothetical protein  31.52 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000135659  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4950  hypothetical protein  28.26 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0214  hypothetical protein  30.53 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0211  hypothetical protein  30.53 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106447  decreased coverage  0.000473791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2131  hypothetical protein  48.57 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4863  hypothetical protein  26.09 
 
 		 97 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0776  Protein of unknown function DUF2136  29.79 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4426  hypothetical protein  24.74 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7325  hypothetical protein  27.96 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5397  hypothetical protein  32.88 
 
 		 74 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.418095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2088  hypothetical protein  28.12 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336628  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2813  hypothetical protein  26.32 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0560809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1147  hypothetical protein  28.26 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0266  hypothetical protein  26.83 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0735  hypothetical protein  31.63 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>