29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31910 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_31910  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0072  hypothetical protein  73.33 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0995766  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1265  Sea40  70.91 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2945  hypothetical protein  68.42 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0295  putative cytoplasmic protein  67.27 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4264  Sea40  67.92 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4242  Sea40  67.92 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4309  hypothetical protein  67.92 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0654025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4355  hypothetical protein  66.04 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4420  hypothetical protein  66.04 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0407  Protein of unknown function DUF2136  53.7 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267838  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0618  conserved hypothetical protein  51.02 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02902  hypothetical protein  51.02 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.895884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4397  hypothetical protein  51.02 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3265  hypothetical protein  51.02 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02952  hypothetical protein  51.02 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0617  hypothetical protein  48.98 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.950813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  44 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  45.24 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  42.86 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  40.82 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0290  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0015092  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6761  Protein of unknown function DUF2136  57.5 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  36.73 
 
 		 95 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2131  hypothetical protein  51.35 
 
 		 87 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  36.73 
 
 		 95 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4802  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.926039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>