53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0618 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0618  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  216  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02902  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.895884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4397  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  216  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02952  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3265  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  216  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0617  hypothetical protein  99.04 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.950813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0072  hypothetical protein  45.45 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0995766  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4264  Sea40  41.41 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4242  Sea40  41.41 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4309  hypothetical protein  41.41 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0654025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4420  hypothetical protein  40.4 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4355  hypothetical protein  40.4 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1265  Sea40  40.4 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2945  hypothetical protein  38.04 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  43.01 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  43.01 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0295  putative cytoplasmic protein  38.38 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  44.57 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  35.87 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  39.13 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0407  Protein of unknown function DUF2136  31.96 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31910  hypothetical protein  51.02 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  36 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  33.7 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  35 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5738  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3550  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4296  hypothetical protein  31.52 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0264  hypothetical protein  30.43 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0544079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5486  hypothetical protein  29.17 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3977  hypothetical protein  29.59 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115023  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2592  hypothetical protein  32.65 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4950  hypothetical protein  29.35 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1596  hypothetical protein  32.61 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1700  hypothetical protein  32.61 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000135659  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0211  hypothetical protein  31.58 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106447  decreased coverage  0.000473791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0214  hypothetical protein  31.58 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2131  hypothetical protein  51.43 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4863  hypothetical protein  27.17 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7325  hypothetical protein  29.03 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4426  hypothetical protein  25.77 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0266  hypothetical protein  28.05 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0776  Protein of unknown function DUF2136  30.85 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2088  hypothetical protein  29.17 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1147  hypothetical protein  29.35 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0735  hypothetical protein  32.65 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2130  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3483  hypothetical protein  23.91 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125562  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2813  hypothetical protein  26.32 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0560809  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4802  hypothetical protein  28.12 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.926039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5397  hypothetical protein  32.88 
 
 		 74 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.418095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1390  hypothetical protein  28.26 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141608  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2786  hypothetical protein  28.28 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>