67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4296 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4296  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  203  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1700  hypothetical protein  49.48 
 
 		 100 aa  96.7  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000135659  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1596  hypothetical protein  49.48 
 
 		 100 aa  96.7  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0776  Protein of unknown function DUF2136  43.43 
 
 		 99 aa  91.3  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1147  hypothetical protein  40.82 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0735  hypothetical protein  48.39 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2130  hypothetical protein  41.24 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4426  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04054  hypothetical protein  43 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4950  hypothetical protein  40.21 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0264  hypothetical protein  40.82 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0544079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2786  hypothetical protein  44.68 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2131  hypothetical protein  52.63 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2481  hypothetical protein  39.18 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.751364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1390  hypothetical protein  35.05 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141608  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3977  hypothetical protein  38.78 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115023  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2592  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4802  hypothetical protein  37.37 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.926039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4863  hypothetical protein  36.08 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2088  hypothetical protein  35.05 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1534  hypothetical protein  35.35 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5486  hypothetical protein  36.08 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2390  hypothetical protein  41.41 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0732526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7325  hypothetical protein  36.08 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1614  hypothetical protein  37.86 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4194  hypothetical protein  36.56 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  41.11 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  41.11 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0266  hypothetical protein  41.25 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5738  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0816  hypothetical protein  35.35 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0252247  hitchhiker  0.00192585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3483  hypothetical protein  34.69 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125562  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  38.46 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0232  hypothetical protein  35.92 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0163906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  31.11 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  36 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  31.11 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4241  hypothetical protein  31.96 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0395236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0536  hypothetical protein  34.02 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0426698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5529  hypothetical protein  34.02 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000518348  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2813  hypothetical protein  34.07 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0560809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3110  hypothetical protein  28.12 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  31.87 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2945  hypothetical protein  27.27 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6761  Protein of unknown function DUF2136  34.44 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02902  hypothetical protein  31.52 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.895884  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0618  conserved hypothetical protein  31.52 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02952  hypothetical protein  31.52 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4397  hypothetical protein  31.52 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3265  hypothetical protein  31.52 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143395 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0214  hypothetical protein  28.57 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0072  hypothetical protein  28.72 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0995766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5397  hypothetical protein  36.62 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.418095 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0211  hypothetical protein  28.57 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106447  decreased coverage  0.000473791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2140  hypothetical protein  48.78 
 
 		 48 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00438563 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0617  hypothetical protein  30.43 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.950813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0727  hypothetical protein  34.07 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0756  hypothetical protein  32.97 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00817316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4355  hypothetical protein  27.66 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4309  hypothetical protein  27.66 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0654025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4242  Sea40  27.66 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4264  Sea40  27.66 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4420  hypothetical protein  26.6 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1265  Sea40  24.47 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4145  hypothetical protein  27.37 
 
 		 110 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.410477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>