41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5397 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5397  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.418095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  42.47 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  41.89 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  39.73 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  43.24 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  39.73 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  43.24 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0735  hypothetical protein  38.03 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  37.84 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4296  hypothetical protein  36.62 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5529  hypothetical protein  40.85 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000518348  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  34.29 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4863  hypothetical protein  40.85 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0816  hypothetical protein  37.68 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0252247  hitchhiker  0.00192585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0264  hypothetical protein  42.03 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0544079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1596  hypothetical protein  32.39 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1700  hypothetical protein  32.39 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000135659  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5738  hypothetical protein  37.31 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2786  hypothetical protein  34.21 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1390  hypothetical protein  36.71 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141608  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4950  hypothetical protein  32.39 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2481  hypothetical protein  31.94 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.751364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1147  hypothetical protein  40.28 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0536  hypothetical protein  32.39 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0426698  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5486  hypothetical protein  30.99 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0214  hypothetical protein  25.71 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2131  hypothetical protein  35 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0211  hypothetical protein  25.71 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106447  decreased coverage  0.000473791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4241  hypothetical protein  28.17 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0395236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7325  hypothetical protein  30.43 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1265  Sea40  28.38 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4194  hypothetical protein  33.8 
 
 		 94 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4397  hypothetical protein  32.88 
 
 		 104 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0617  hypothetical protein  32.88 
 
 		 104 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.950813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2592  hypothetical protein  24.29 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02902  hypothetical protein  32.88 
 
 		 104 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.895884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4426  hypothetical protein  34.78 
 
 		 98 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02952  hypothetical protein  32.88 
 
 		 104 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3265  hypothetical protein  32.88 
 
 		 104 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0618  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 		 104 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1283  hypothetical protein  31.51 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0732526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>