48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1265 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1265  Sea40  100 
 
 		 103 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0295  putative cytoplasmic protein  83.5 
 
 		 104 aa  168  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0072  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0995766  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4264  Sea40  59.22 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4242  Sea40  59.22 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4309  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0654025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2945  hypothetical protein  59.18 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4355  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4420  hypothetical protein  57.28 
 
 		 103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0407  Protein of unknown function DUF2136  44.55 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31910  hypothetical protein  70.91 
 
 		 60 aa  90.9  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0618  conserved hypothetical protein  40.4 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02902  hypothetical protein  40.4 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.895884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4397  hypothetical protein  40.4 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3265  hypothetical protein  40.4 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02952  hypothetical protein  40.4 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0617  hypothetical protein  39.39 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.950813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  35.87 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  35.87 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  36.56 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  34.41 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  35.42 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  32.29 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  32.29 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  30.11 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1596  hypothetical protein  29.79 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1700  hypothetical protein  29.79 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000135659  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0264  hypothetical protein  28.72 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0544079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5738  hypothetical protein  32.61 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4863  hypothetical protein  30.85 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0211  hypothetical protein  30.21 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106447  decreased coverage  0.000473791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0214  hypothetical protein  30.21 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2592  hypothetical protein  30.21 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0816  hypothetical protein  28.42 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0252247  hitchhiker  0.00192585 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5486  hypothetical protein  26.6 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189527 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6761  Protein of unknown function DUF2136  26.26 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4296  hypothetical protein  24.47 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2131  hypothetical protein  32.35 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2481  hypothetical protein  29.79 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.751364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1283  hypothetical protein  31.25 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0732526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2786  hypothetical protein  29.58 
 
 		 101 aa  42  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5397  hypothetical protein  28.38 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.418095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0735  hypothetical protein  25 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0727  hypothetical protein  26.88 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1390  hypothetical protein  25.49 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141608  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04054  hypothetical protein  27.27 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4950  hypothetical protein  26.6 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1147  hypothetical protein  24.47 
 
 		 103 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>