25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0407 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0407  Protein of unknown function DUF2136  100 
 
 		 101 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4242  Sea40  49.5 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4264  Sea40  49.5 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4309  hypothetical protein  49.5 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0654025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4355  hypothetical protein  48.51 
 
 		 103 aa  116  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4420  hypothetical protein  47.52 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0072  hypothetical protein  44.55 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0995766  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1265  Sea40  44.55 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0295  putative cytoplasmic protein  40.59 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2945  hypothetical protein  36.46 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31910  hypothetical protein  53.7 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02952  hypothetical protein  31.96 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3265  hypothetical protein  31.96 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4397  hypothetical protein  31.96 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02902  hypothetical protein  31.96 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.895884  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0618  conserved hypothetical protein  31.96 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0617  hypothetical protein  30.93 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.950813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  33.75 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  25.56 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  25.56 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  35.06 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  28.09 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  27.85 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  26.58 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>