43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4242 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4264  Sea40  100 
 
 		 103 aa  214  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4242  Sea40  100 
 
 		 103 aa  214  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4309  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  214  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0654025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4355  hypothetical protein  99.03 
 
 		 103 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4420  hypothetical protein  98.06 
 
 		 103 aa  210  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0072  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0995766  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1265  Sea40  59.22 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0407  Protein of unknown function DUF2136  49.5 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0295  putative cytoplasmic protein  57.28 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2945  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02952  hypothetical protein  41.41 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02902  hypothetical protein  41.41 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.895884  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3265  hypothetical protein  41.41 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4397  hypothetical protein  41.41 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0618  conserved hypothetical protein  41.41 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0617  hypothetical protein  40.4 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.950813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31910  hypothetical protein  67.92 
 
 		 60 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  38.71 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  29.35 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  29.35 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  31.18 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  34.34 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5486  hypothetical protein  27.08 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  28.42 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4296  hypothetical protein  27.66 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  27.37 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5738  hypothetical protein  26.73 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4426  hypothetical protein  28.42 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4863  hypothetical protein  24.47 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4950  hypothetical protein  30.21 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0816  hypothetical protein  26.8 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0252247  hitchhiker  0.00192585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7325  hypothetical protein  28.28 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0727  hypothetical protein  24.73 
 
 		 93 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1390  hypothetical protein  26.8 
 
 		 101 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141608  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4802  hypothetical protein  28.43 
 
 		 104 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.926039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0756  hypothetical protein  24.73 
 
 		 93 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00817316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4241  hypothetical protein  28.87 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0395236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3483  hypothetical protein  20.21 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125562  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0264  hypothetical protein  23.4 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0544079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0214  hypothetical protein  25 
 
 		 100 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0211  hypothetical protein  25 
 
 		 100 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106447  decreased coverage  0.000473791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>