13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0290 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0290  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0015092  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2535  hypothetical protein  28.45 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324551  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1711  putative uncharacterized protein, YgjN-like protein  26.72 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31910  hypothetical protein  51.28 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2130  hypothetical protein  28.18 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3936  hypothetical protein  29.2 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0899  hypothetical protein  26.36 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3985  hypothetical protein  29.2 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921901  normal  0.053798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0774  hypothetical protein  52.78 
 
 		 97 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2131  hypothetical protein  32.98 
 
 		 87 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3977  hypothetical protein  27.35 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115023  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17250  hypothetical protein  28.18 
 
 		 94 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0380  hypothetical protein  28.18 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.982698  normal  0.0284387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>