More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3872 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3872  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0405  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  69.47 
 
 
304 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0413  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  69.12 
 
 
312 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4819  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  68.14 
 
 
318 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0629  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  67.44 
 
 
319 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0631  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  69.12 
 
 
309 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.830849  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0390  hypothetical protein  70.07 
 
 
279 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0532843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1061  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  66.55 
 
 
313 aa  352  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  68.99 
 
 
286 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3767  hypothetical protein  61.59 
 
 
304 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84999  normal  0.0491283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1640  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  57.82 
 
 
354 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0924245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0122  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.82 
 
 
291 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3464  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  52.9 
 
 
300 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0201  hypothetical protein  56.91 
 
 
296 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0215  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  57.19 
 
 
296 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405558 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  56.44 
 
 
295 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0815274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0404  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  54.64 
 
 
293 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3431  hypothetical protein  55.59 
 
 
299 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36467  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3390  methyltransferase  57.05 
 
 
293 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3149  hypothetical protein  56.07 
 
 
295 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3266  hypothetical protein  54.95 
 
 
300 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3136  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  53.24 
 
 
300 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3266  hypothetical protein  55.41 
 
 
299 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4314  hypothetical protein  54.64 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2817  hypothetical protein  57.39 
 
 
276 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0289  hypothetical protein  57.39 
 
 
276 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3820  tetrapyrrole methylase family protein  55.74 
 
 
295 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3901  tetrapyrrole methylase family protein  55.74 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0042  hypothetical protein  55.41 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0196  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  56.67 
 
 
292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000023341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2802  tetrapyrrole methylase family protein  56.61 
 
 
295 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.460995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3175  tetrapyrrole methylase family protein  56.61 
 
 
295 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1741  tetrapyrrole methylase family protein  56.61 
 
 
295 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0025  tetrapyrrole methylase family protein  56.61 
 
 
295 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2281  hypothetical protein  53.33 
 
 
281 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.610951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0504  hypothetical protein  50.89 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.48072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3439  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  55.63 
 
 
295 aa  235  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  47.35 
 
 
286 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  45.71 
 
 
282 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0108  hypothetical protein  51.79 
 
 
397 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0368422 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  45.02 
 
 
288 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  44.9 
 
 
293 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  45.36 
 
 
287 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0034  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.57 
 
 
298 aa  222  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  47.52 
 
 
286 aa  221  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  47.35 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.35 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  47.35 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  47.35 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.35 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  47.35 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  44.8 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  47.16 
 
 
286 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  46.15 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  46.15 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  46.15 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  44.37 
 
 
281 aa  219  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  46.15 
 
 
287 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  43.99 
 
 
304 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  43.97 
 
 
280 aa  216  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  43.82 
 
 
281 aa  215  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.14 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  41.81 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  44.14 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.2 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  44.14 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  44.14 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.29 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  43.62 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1178  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.68 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  43.06 
 
 
280 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3452  hypothetical protein  46.34 
 
 
287 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.82 
 
 
280 aa  212  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  43.01 
 
 
280 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  44.84 
 
 
287 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.01 
 
 
280 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  42.31 
 
 
291 aa  209  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0030  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.43 
 
 
297 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0001068  hitchhiker  0.00000138683 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0196  hypothetical protein  45.91 
 
 
288 aa  209  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2211  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.53 
 
 
293 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.165354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0309  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.06 
 
 
295 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  43.99 
 
 
292 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.16 
 
 
280 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.35 
 
 
280 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.55 
 
 
272 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.45 
 
 
287 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2101  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.83 
 
 
307 aa  205  9e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0315  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.47 
 
 
295 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  44.64 
 
 
287 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.64 
 
 
280 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.64 
 
 
280 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3583  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.8 
 
 
288 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.200814 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.64 
 
 
280 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  42.2 
 
 
281 aa  202  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0934  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.3 
 
 
291 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.37 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  41.84 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4011  hypothetical protein  44.6 
 
 
303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.301912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  46.86 
 
 
265 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4335  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.72 
 
 
287 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743179  normal  0.137382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>