More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0504 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0504  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.48072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2281  hypothetical protein  55.91 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.610951 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  52.92 
 
 
286 aa  280  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0122  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.38 
 
 
291 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  49.45 
 
 
287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.62 
 
 
299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  53.09 
 
 
287 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  53.28 
 
 
286 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  53.28 
 
 
286 aa  271  9e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.28 
 
 
286 aa  271  9e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  53.28 
 
 
286 aa  271  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  53.28 
 
 
286 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  53.33 
 
 
287 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  53.33 
 
 
287 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  52.92 
 
 
286 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  53.33 
 
 
287 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  53.28 
 
 
286 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  53.33 
 
 
287 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.38 
 
 
280 aa  269  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0215  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  57.71 
 
 
296 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  53.26 
 
 
287 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  53.51 
 
 
281 aa  267  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3390  methyltransferase  57.35 
 
 
293 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  58.06 
 
 
295 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0815274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0201  hypothetical protein  57.71 
 
 
296 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  53.07 
 
 
287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  50.54 
 
 
287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  50.74 
 
 
288 aa  265  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  51.27 
 
 
304 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.64 
 
 
280 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  51.47 
 
 
293 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  51.85 
 
 
280 aa  262  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.46 
 
 
299 aa  262  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0404  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  55.11 
 
 
293 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  51.46 
 
 
299 aa  262  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  51.46 
 
 
299 aa  262  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  52.5 
 
 
287 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0309  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.65 
 
 
295 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3439  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  58.76 
 
 
295 aa  259  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.92 
 
 
280 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  52 
 
 
280 aa  259  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2817  hypothetical protein  57.35 
 
 
276 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0289  hypothetical protein  57.35 
 
 
276 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3583  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.36 
 
 
288 aa  258  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.200814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3452  hypothetical protein  52.96 
 
 
287 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  50 
 
 
289 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2101  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.74 
 
 
307 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0315  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.92 
 
 
295 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656029  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  51.99 
 
 
281 aa  255  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  51.99 
 
 
281 aa  255  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  50.9 
 
 
281 aa  254  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3149  hypothetical protein  54.87 
 
 
295 aa  254  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3464  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  52.69 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0196  hypothetical protein  52 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.18 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.55 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.82 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4314  hypothetical protein  55.47 
 
 
292 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.36 
 
 
280 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.36 
 
 
280 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.36 
 
 
280 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  48.73 
 
 
282 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03354  putative methyltransferase  48.91 
 
 
292 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  50.36 
 
 
280 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.36 
 
 
280 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  49.46 
 
 
320 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4398  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.04 
 
 
291 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.258286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.5 
 
 
272 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  49.46 
 
 
282 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1178  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.41 
 
 
286 aa  249  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.04 
 
 
294 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0934  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.68 
 
 
291 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0196  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  57.25 
 
 
292 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000023341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4522  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.68 
 
 
291 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  50.9 
 
 
281 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4335  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.01 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743179  normal  0.137382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3820  tetrapyrrole methylase family protein  53.6 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3266  hypothetical protein  53.9 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3901  tetrapyrrole methylase family protein  53.6 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  49.64 
 
 
286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3136  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  53.41 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0042  hypothetical protein  53.99 
 
 
295 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  49.64 
 
 
291 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0108  hypothetical protein  54.41 
 
 
397 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0368422 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2802  tetrapyrrole methylase family protein  53.62 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.460995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  48.01 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1741  tetrapyrrole methylase family protein  53.62 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3175  tetrapyrrole methylase family protein  53.62 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0025  tetrapyrrole methylase family protein  53.62 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306155  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  49.62 
 
 
273 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  45.52 
 
 
281 aa  239  4e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.62 
 
 
273 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0390  hypothetical protein  50.92 
 
 
279 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0532843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2393  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.84 
 
 
293 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957737  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1640  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.06 
 
 
354 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0924245 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0405  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.75 
 
 
304 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3872  hypothetical protein  50.53 
 
 
299 aa  235  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0413  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.75 
 
 
312 aa  235  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  45.93 
 
 
291 aa  234  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  49.62 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>