More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0108 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  791    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0368422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2281  hypothetical protein  56.78 
 
 		 281 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.610951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  55.84 
 
 		 299 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  54.24 
 
 		 293 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3464  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  56.43 
 
 		 300 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  51.84 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  52.82 
 
 		 287 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0404  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  54.18 
 
 		 293 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0405  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  54.23 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3390  methyltransferase  54.3 
 
 		 293 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  52.03 
 
 		 304 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0413  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.87 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  51.82 
 
 		 289 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.86 
 
 		 295 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0815274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3149  hypothetical protein  56.78 
 
 		 295 aa  255  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  47.7 
 
 		 287 aa  255  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0122  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.66 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  50 
 
 		 287 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4314  hypothetical protein  56.46 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0201  hypothetical protein  55.8 
 
 		 296 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0215  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  55.8 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0390  hypothetical protein  55.88 
 
 		 279 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0532843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2817  hypothetical protein  55.72 
 
 		 276 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0289  hypothetical protein  55.72 
 
 		 276 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3136  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  57.5 
 
 		 300 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  48.06 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4522  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.98 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.98 
 
 		 294 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4398  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.98 
 
 		 291 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.258286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  54.58 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.16 
 
 		 280 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  52.04 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  52.06 
 
 		 272 aa  245  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  49.44 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.11 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  51.11 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  51.11 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3820  tetrapyrrole methylase family protein  54.87 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0196  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  55.56 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000023341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3901  tetrapyrrole methylase family protein  54.87 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  53.07 
 
 		 282 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4819  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  53.71 
 
 		 318 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3431  hypothetical protein  55.16 
 
 		 299 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0042  hypothetical protein  58.9 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3175  tetrapyrrole methylase family protein  58.9 
 
 		 295 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2802  tetrapyrrole methylase family protein  58.9 
 
 		 295 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.460995  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1640  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.41 
 
 		 354 aa  242  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0924245 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0025  tetrapyrrole methylase family protein  58.9 
 
 		 295 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1741  tetrapyrrole methylase family protein  58.9 
 
 		 295 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  49.25 
 
 		 273 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0934  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.77 
 
 		 291 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0504  hypothetical protein  54.41 
 
 		 279 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.48072 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.25 
 
 		 273 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0196  hypothetical protein  50.36 
 
 		 288 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312709  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  49.81 
 
 		 287 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3439  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  56.04 
 
 		 295 aa  239  8e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  49.81 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.81 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.44 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  49.81 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  49.81 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  49.44 
 
 		 286 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  48.71 
 
 		 281 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  49.44 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  49.44 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  49.44 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1178  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.17 
 
 		 286 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  48.35 
 
 		 281 aa  236  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  49.26 
 
 		 287 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.41 
 
 		 280 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.41 
 
 		 280 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  49.07 
 
 		 286 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  48.34 
 
 		 281 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.41 
 
 		 280 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.64 
 
 		 292 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  47.08 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  45.61 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3266  hypothetical protein  56.23 
 
 		 300 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.26 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0315  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.1 
 
 		 295 aa  234  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656029  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  47.06 
 
 		 280 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3767  hypothetical protein  54.35 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84999  normal  0.0491283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.41 
 
 		 280 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  48.53 
 
 		 281 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  47.97 
 
 		 281 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  47.6 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0309  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.96 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1061  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.07 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  55.2 
 
 		 286 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.04 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4335  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.93 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743179  normal  0.137382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3583  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.82 
 
 		 288 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.200814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0629  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.13 
 
 		 319 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3266  hypothetical protein  54.87 
 
 		 299 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3872  hypothetical protein  50.71 
 
 		 299 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.29 
 
 		 280 aa  225  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0631  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.79 
 
 		 309 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.830849  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3144  putative methyltransferase  47.97 
 
 		 280 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  48.67 
 
 		 265 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3452  hypothetical protein  49.07 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>