More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3060 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1172  IS66 Orf2 like  100 
 
 		 111 aa  223  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.768897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3060  IS66 Orf2 like  100 
 
 		 111 aa  223  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2710  IS66 Orf2 like  95.5 
 
 		 111 aa  216  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2522  IS66 Orf2 family protein  73.87 
 
 		 110 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1021  IS66 Orf2 family protein  73.87 
 
 		 110 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1191  IS66 Orf2 family protein  73.87 
 
 		 110 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1402  IS66 Orf2 family protein  73.87 
 
 		 110 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3500  ISPpu14, transposase Orf2  70.27 
 
 		 111 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3965  ISPpu14, transposase Orf2  70.27 
 
 		 111 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3980  ISPpu14, transposase Orf2  70.27 
 
 		 111 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4438  ISPpu14, transposase Orf2  70.27 
 
 		 111 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000480323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59570  putative transposase  71.17 
 
 		 111 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207074  hitchhiker  4.45404e-19 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5983  IS66 Orf2 family protein  72.07 
 
 		 110 aa  167  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0038  IS66 Orf2 family protein  69.37 
 
 		 111 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4442  ISPpu14, transposase Orf2  69.37 
 
 		 111 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5397  ISPpu14, transposase Orf2  69.37 
 
 		 111 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  hitchhiker  0.00237418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5174  IS66 Orf2 family protein  70.27 
 
 		 111 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417  IS66 family transposase  70.54 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221323  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1866  transposase, Orf2 like  70.54 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733675  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0746  IS66 Orf2 like  70.27 
 
 		 121 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3793  putative transposase  69.64 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6938  IS66 Orf2 family protein  69.64 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0711  IS66 Orf2 family protein  68.47 
 
 		 110 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0423  IS66 Orf2 family protein  80.21 
 
 		 95 aa  159  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4022  IS66 Orf2 family protein  66.67 
 
 		 111 aa  156  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1169  IS66 Orf2 family protein  63.96 
 
 		 111 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.730957  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4448  IS66 Orf2 family protein  62.83 
 
 		 113 aa  143  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.657267  normal  0.0820923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0571  IS66 Orf2 family protein  65.05 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.915168  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2456  IS66 Orf2 family protein  65.05 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.912363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2917  IS66 Orf2 family protein  65.05 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4706  IS66 Orf2 family protein  61.26 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343016  normal  0.106133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1486  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2668  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.89024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3323  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0834  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.323276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2976  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4708  IS66 Orf2 family protein  58.33 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123105  normal  0.103462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1058  IS66 Orf2 family protein  49.06 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.66521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1089  IS66 Orf2 family protein  49.06 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1481  IS66 Orf2 family protein  49.06 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1365  IS66 Orf2 family protein  49.06 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  47.96 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  47.96 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  47.96 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  47.96 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  47.96 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  47.96 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  46.94 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  45.63 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  45.63 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  45.63 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2256  IS66 Orf2 family protein  38.83 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.286379  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  41.84 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  40.95 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1087  IS66 Orf2 like protein  35.92 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  37.5 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  42.71 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3197  IS66 Orf2 family protein  34.74 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3699  hypothetical protein  33.68 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.603868 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4398  IS66 Orf2 family protein  33.68 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201394  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  39.8 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  39.8 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  37.76 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  39.8 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  39.58 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  39.8 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  39.8 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  39.8 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  36.84 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  37.76 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  36.08 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  36.46 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  36.46 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  38.54 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  36.08 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  36.08 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  36.08 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  36.08 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  36.08 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0258  hypothetical protein  34.02 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0620314 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  36.08 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  39.8 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  35.05 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  32.65 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  36.08 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2590  putative transposase, TnpB  32.71 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  37.11 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  37.11 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  40.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  40.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  40.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  40.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  40.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  40.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  40.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  40.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  40.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  40.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0398  IS66 Orf2 like  34.74 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  33.33 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>