More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3793 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3793  putative transposase  100 
 
 		 122 aa  243  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417  IS66 family transposase  99.11 
 
 		 112 aa  224  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221323  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1866  transposase, Orf2 like  99.11 
 
 		 112 aa  224  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733675  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6938  IS66 Orf2 family protein  84.82 
 
 		 112 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1172  IS66 Orf2 like  69.64 
 
 		 111 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.768897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3060  IS66 Orf2 like  69.64 
 
 		 111 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2710  IS66 Orf2 like  70.54 
 
 		 111 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2522  IS66 Orf2 family protein  69.64 
 
 		 110 aa  160  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1021  IS66 Orf2 family protein  69.64 
 
 		 110 aa  160  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1402  IS66 Orf2 family protein  69.64 
 
 		 110 aa  160  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1191  IS66 Orf2 family protein  69.64 
 
 		 110 aa  160  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0711  IS66 Orf2 family protein  70.54 
 
 		 110 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5983  IS66 Orf2 family protein  69.64 
 
 		 110 aa  155  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59570  putative transposase  68.42 
 
 		 111 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207074  hitchhiker  4.45404e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3500  ISPpu14, transposase Orf2  67.54 
 
 		 111 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3965  ISPpu14, transposase Orf2  67.54 
 
 		 111 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3980  ISPpu14, transposase Orf2  67.54 
 
 		 111 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4438  ISPpu14, transposase Orf2  67.54 
 
 		 111 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000480323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0746  IS66 Orf2 like  64.52 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4022  IS66 Orf2 family protein  66.07 
 
 		 111 aa  154  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0038  IS66 Orf2 family protein  66.67 
 
 		 111 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4442  ISPpu14, transposase Orf2  67.54 
 
 		 111 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5397  ISPpu14, transposase Orf2  67.54 
 
 		 111 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  hitchhiker  0.00237418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5174  IS66 Orf2 family protein  67.54 
 
 		 111 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1169  IS66 Orf2 family protein  65.18 
 
 		 111 aa  146  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.730957  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0571  IS66 Orf2 family protein  68.27 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.915168  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2456  IS66 Orf2 family protein  68.27 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.912363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2917  IS66 Orf2 family protein  68.27 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0423  IS66 Orf2 family protein  69.07 
 
 		 95 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4448  IS66 Orf2 family protein  57.69 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.657267  normal  0.0820923 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4706  IS66 Orf2 family protein  57.69 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343016  normal  0.106133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2668  IS66 Orf2 family protein  63.92 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.89024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3323  IS66 Orf2 family protein  63.92 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2976  IS66 Orf2 family protein  63.92 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0834  IS66 Orf2 family protein  63.92 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.323276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1486  IS66 Orf2 family protein  63.92 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214509 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4708  IS66 Orf2 family protein  57.3 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123105  normal  0.103462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1481  IS66 Orf2 family protein  36.84 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1089  IS66 Orf2 family protein  36.84 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1365  IS66 Orf2 family protein  36.84 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1058  IS66 Orf2 family protein  36.84 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.66521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  47.92 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  47.92 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  47.92 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  47.92 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  47.92 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  47.92 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  47.92 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  44.44 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  44.44 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  44.44 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2256  IS66 Orf2 family protein  40 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.286379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1087  IS66 Orf2 like protein  30.83 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  42.27 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  37.76 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  40 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  39.18 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  38.38 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  38.14 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  35.71 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  35.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  35.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  35.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  35.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  35.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  38.38 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  39.8 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3677  IS66 Orf2 family protein  32.71 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  37.11 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  35.71 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  35.71 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3925  IS66 Orf2 family protein  32.71 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  34.69 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3965  IS66 Orf2 family protein  32.71 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  38.2 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  37.37 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  33.66 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3332  IS66 Orf2 family protein  32.71 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  34.69 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  36.46 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2840  IS66 family element, orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0069  IS66 family orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2223  IS66 family element, orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0126387  hitchhiker  0.00000000000242445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3385  IS66 family orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  36.73 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3875  IS66 family element, orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  35.42 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1761  IS66 family orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0020  IS66 family orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0343  IS66 family element, orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000139365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  34.91 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1182  IS66 family element, orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  35.42 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4861  IS66 family orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4878  IS66 family orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5042  IS66 family element, orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3699  hypothetical protein  32.29 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.603868 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0039  IS66 family orf2  34.69 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4398  IS66 Orf2 family protein  32.29 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201394  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  35.42 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>