130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1481 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1058  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
114 aa  238  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.66521  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1089  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
114 aa  238  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1365  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
114 aa  238  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0579421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1481  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
114 aa  238  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160906 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4022  IS66 Orf2 family protein  51.75 
 
 
111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1172  IS66 Orf2 like  49.06 
 
 
111 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.768897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3060  IS66 Orf2 like  49.06 
 
 
111 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3500  ISPpu14, transposase Orf2  43.97 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3965  ISPpu14, transposase Orf2  43.97 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3980  ISPpu14, transposase Orf2  43.97 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4438  ISPpu14, transposase Orf2  43.97 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000480323 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2522  IS66 Orf2 family protein  46.09 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1191  IS66 Orf2 family protein  46.09 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1402  IS66 Orf2 family protein  46.09 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0038  IS66 Orf2 family protein  43.97 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1021  IS66 Orf2 family protein  46.09 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4442  ISPpu14, transposase Orf2  43.97 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5397  ISPpu14, transposase Orf2  43.97 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  hitchhiker  0.00237418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2710  IS66 Orf2 like  48.11 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59570  putative transposase  43.1 
 
 
111 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207074  hitchhiker  4.45404e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5174  IS66 Orf2 family protein  43.1 
 
 
111 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0746  IS66 Orf2 like  44.44 
 
 
121 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1169  IS66 Orf2 family protein  41.82 
 
 
111 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.730957  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5983  IS66 Orf2 family protein  40.35 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0711  IS66 Orf2 family protein  39.5 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0571  IS66 Orf2 family protein  42.45 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.915168  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2456  IS66 Orf2 family protein  42.45 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.912363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2917  IS66 Orf2 family protein  42.45 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.722189  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417  IS66 family transposase  37.72 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221323  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1866  transposase, Orf2 like  37.72 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733675  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6938  IS66 Orf2 family protein  38.6 
 
 
112 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3793  putative transposase  36.84 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4448  IS66 Orf2 family protein  38.1 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.657267  normal  0.0820923 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4706  IS66 Orf2 family protein  39.05 
 
 
113 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343016  normal  0.106133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0423  IS66 Orf2 family protein  40.82 
 
 
95 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0834  IS66 Orf2 family protein  41.05 
 
 
96 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.323276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2668  IS66 Orf2 family protein  41.05 
 
 
96 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.89024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2976  IS66 Orf2 family protein  41.05 
 
 
96 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1486  IS66 Orf2 family protein  41.05 
 
 
96 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3323  IS66 Orf2 family protein  41.05 
 
 
96 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4708  IS66 Orf2 family protein  36.67 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123105  normal  0.103462 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  35.4 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  34.51 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  34.51 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  34.51 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  34.51 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  34.51 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  34.51 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1087  IS66 Orf2 like protein  32.14 
 
 
221 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  33.03 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  32.41 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  33.33 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  32.41 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  32.41 
 
 
117 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2256  IS66 Orf2 family protein  33.02 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.286379  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  29.36 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  33.04 
 
 
115 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2996  IS66 Orf2 like  30.28 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  31.07 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  31.07 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  28.71 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  31.07 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3699  hypothetical protein  30.39 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.603868 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4398  IS66 Orf2 family protein  30.39 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  32.38 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  28.71 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  32.38 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  28.7 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  28.71 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  31.31 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  28.71 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3197  IS66 Orf2 family protein  29.41 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  30.39 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  28.7 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  29.09 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  28.57 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  31.48 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4745  IS66 Orf2 family protein  30.53 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00363  Transposase and inactivated derivative  32.74 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  27.72 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01284  Transposase and inactivated derivative  32.74 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000849512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01415  Transposase and inactivated derivative  32.74 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  31.48 
 
 
115 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  28.43 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7465  IS66 Orf2 family protein  26.04 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  36.36 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  30.63 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  30.48 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>