23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0482 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  387  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  72.73 
 
 		 203 aa  243  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  36.27 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  36.84 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  34.84 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  26.32 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  31.34 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  30.67 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  28.75 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  31.29 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  32.64 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  28.65 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1338  hypothetical protein  28.42 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  28.75 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  28.66 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  28.8 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  29.03 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  29.03 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  29.95 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  29.01 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  28.93 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0334  hypothetical protein  26.32 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  25.87 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>