13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1338 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1338  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0611  hypothetical protein  84.85 
 
 		 165 aa  275  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.895734 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  30.32 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  28.42 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  29.83 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3235  hypothetical protein  29.03 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.3467  normal  0.937712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  28.66 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  27.78 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  30.77 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  26.17 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  28.79 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  28.48 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  39.22 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>