23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2030 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  49.73 
 
 		 193 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  47.85 
 
 		 192 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  48.13 
 
 		 193 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  47.93 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  31.55 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  32.07 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  30.9 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3235  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.3467  normal  0.937712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  28.35 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  30.72 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  31.06 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1338  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  32 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  26.9 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  27.81 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0611  hypothetical protein  28.03 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.895734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  28.19 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  29.14 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  29.14 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0334  hypothetical protein  22.84 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  28.88 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>