19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6972 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  62.3 
 
 
200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  46.74 
 
 
200 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  46.78 
 
 
194 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  47.95 
 
 
190 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1086  hypothetical protein  43.48 
 
 
200 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  32.8 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  30.11 
 
 
195 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  28.65 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  32.1 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  25.79 
 
 
202 aa  52  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  29.55 
 
 
204 aa  52  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  30.5 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  29.17 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  34.64 
 
 
203 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0260  hypothetical protein  43.14 
 
 
110 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0108254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  29.03 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1338  hypothetical protein  39.22 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  29.2 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>